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Bioinformática y Bioestadística en Microbiología Ambiental. Nivel Avanzado Ambiental y “speech training”

Código: 18GR54 Granada
01/10/2018 al 05/10/2018

Dirección:
Mohamed L. Merroun, Departamento de Microbiología, Facultad de Ciencias.
Ramiro Vílchez Vargas,Investigador Contratado Doctor. Universitäsklinikum Magdeburg, Alemania.

Lugar de realización
Aula OS01 (Aula de Informática), Facultad de Ciencias (Granada).

Reconocimiento de créditos
Reconocimiento de créditos ECTS OPTATIVOS en los Grados

1,3 créditos ECTS OPTATIVOS en el Grado en Farmacia
1,3 créditos ECTS OPTATIVOS en el Grado en Nutrición Humana y Dietética
1,3 créditos ECTS OPTATIVOS en el Grado en Ciencia y Tecnología de los Alimentos
2 créditos ECTS OPTATIVOS en el Grado en Biología
3 créditos ECTS OPTATIVOS en el Grado en Biotecnología
1,5 créditos ECTS OPTATIVOS en el Grado en Ciencias Ambientales
1,5 créditos ECTS OPTATIVOS en el Grado en Estadística

Este curso podrá ser convalidado por créditos de libre configuración en las titulaciones a extinguir

Justificación del curso y objetivos
Las técnicas de secuenciación masiva se aplicarán en un futuro próximo en campos como la medicina personalizada, siendo previsible que haya demanda de licenciados con conocimientos en biología o bioquímica pero además con conocimientos en bioinformática y bioestadística.
En el nivel básico del curso se enseñó a anotar taxonómicamente, hacer la rectas de rarefacción, elaborar dendogramas usando diferentes algoritmos, realizar PCoa, NMDS, PCA y CA, ANOSIM, PERMANOVA, calcular los índices medioambientales, Heatmaps, SIMPER, test de Wilcoxon y Pearson, así como a realizar “Communities Network”.

Competencias del alumnado:
a)Aprender a elaborar el diseño experimental adecuado para alcanzar el objetivo propuesto.
b)Aprender a analizar muestras de forma eficiente usando los conocimientos en estadística e informática previamente adquiridos.
c)Profundizar en el manejo de programas bioinformáticos de análisis de diversidad y actividad microbiana.
d)Aprender a exponer los resultados de una forma clara y concisa.

Lunes, 1 de octubre 2018

14:00-20:00 Metodología general con Ejemplo práctico (general a toda la clase).
Ramiro Vílchez Vargas.

Martes, 2 de octubre 2018

14:00-20:00 Trabajo por grupos tutelado por el profesor en los respectivos grupos de muestras.
Ramiro Vílchez Vargas.

Miércoles, 3 de octubre 2018

14:00-20:00 Trabajo por grupos tutelado por el profesor en los respectivos grupos de muestras.
Ramiro Vílchez Vargas.

Jueves, 4 de octubre 2018

15:00-20:00 Presentaciones por grupo o individuales (15 min máximo por estudiante).
Ramiro Vílchez Vargas.

Viernes, 5 de octubre 2018

15:00-20:00 Presentaciones por grupo o individuales (15 min máximo por estudiante).Dudas y sugerencias. Mesa redonda. Calificaciones finales.
Ramiro Vílchez Vargas.